Bueno, la exactitud se pierde por varias razones.
Una, como bien has dicho, es por el tiempo.
Otra razón importante es por la temperatura ambiente o por los ciclos de histéresis térmica.
A veces la medida cambia sólo por apagar y volver a encender el aparato.
También las vibraciones o las fuerzas sobre el PCB pueden modificar la exactitud.
Cuando el rango de temperaturas es tan amplio, la linealidad es una fuente importante de error en la exactitud.
El ruido ambiente o las corrientes de aire también pueden quitar exactitud.
Las uniones de varios metales forman termopares que alteran la medida.
Los hilos de conexión con la RTD aumentan artificialmente la resistencia. Hay que utilizar mejor 4 hilos (medición kelvin).
El autocalentamiento de la RTD puede afectar la medida. Hay que alimentar la RTD con la menor corriente posible.
Los conversores ADC de tipo SAR no son muy lineales. Mira los detalles del fabricante. Muchos conversores de 16bits apenas consiguen una linealidad de 12 bits.
Los conversores ADC de tipo Sigma-Delta son más lineales y dan muchos bits de precisión, pero se comportan mal cerca de las tensiones de alimentación y son mucho más lentos.
Muchos de estos errores se pueden compensar con el microcontrolador, otros tienes que compensarlos con un buen diseño (por ejemplo reduciendo el autocalentamiento o con una medición kelvin de 4 hilos) y otros errores se compensan periódicamente con una calibración.
Dependiendo de la exactitud que quieras, tendrás que tener en cuenta algunos de estos errores o no.
Saludos.