La versión de sistema operativo de la RPI, no tiene nada que ver, pero si es importante que Pc y RPI estén sincronizados, con todos los útiles y librerías a la misma versión. En los pasos para instalar y configurar el compilador, has hecho algo mal.
Te está usando el make de QT para Windows, y además como no tienes instalado el compilador MinGW (versión de GCC para Windows), no encuentra el comando para la compilación, pero el problema no es ese.
El proceso Qmake te lo hace bien, pero el make que te está usando es el de QT para programas bajo Windows, no el de la compilación cruzada, que está en SysGCC, por eso casca. Si está todo bien configurado, cuando se crea un proyecto, todo eso se crea automáticamente, tanto qmake como make, en base a las definiciones en mkspecs y la configuración en Build and Run.
Mira a ver que PATH tienes en el sistema, a ver si te falta alguna ruta de acceso a binarios.
Otra cosa que puedes hacer, aunque no es la solución, pero al menos para probar, es quitar en el proyecto, el proceso make.bat y crear a mano el make.exe apuntando al directorio de los binarios de RPI (SysGCC), al menos podrás probar si funciona la compilación cruzada. No es una solución definitiva, porque algo que debería de crearse automáticamente, lo tendrías que modificar a mano para cada proyecto.