Hay un PIC18 que tiene 7 PWM
Un Atmega2561 tiene 12 PWM programables de 2 a 16 bits.
Luego, en general, no se puede decir nada de cual es mejor. Lo que si se puede decir es las características de cada uno, los MIPS son una mentira más grande...
Ejemplo, en 8bits de ambas familias, te dicen corre a X MIPS pero no te explican cuantas instrucciones son necesarias para, por ejemplo, dividir un número de 16bits. El PIC por ejemplo con su arquitectura de monoacumulador nunca va a ser mejor que su competencia.
Además, decir que se va a X MIPS y necesitar tener un oscialdor de X Mhz no es lo mismo que el micro rinda X MIPS y solo necesite X/4 Mhz, y esto importa y mucho ante regulaciones de radiofrecuencia (como la FCC en USA), y tampoco es lo mismo el consumo de un micro a 48Mhz que a 12Mhz.
Las comparaciones son siempre odiosas, por eso cada vez que me preguntan digo:
"El mejor es el que más conozcas".