Claro, puedes mostrar y ocultar las capas a tu antojo. Hay varias formas de hacerlo, aunque quizás la más sencilla sea darle con el botón derecho del ratón sobre el nombre de la capa a ocultar en la parte inferior (Bottom overlay) y elegir la opción "Hide".
En cualquier momento, puedes configurar lo que quieres ver si haces click sobre "Curren layer", situado en la parte izquierda de los nombres de todas las capas, junto al texto "LS".
Ahí se te abrirá una ventana donde puedes poner y quitar check box sobre cada capa.