Hola,
pues si, yo he trabajado con fibras y micros y no hay ningún problema, además a veces con modulaciones un poco complejas y siempre bien. Lo único que tienes que tener en cuenta es, dependiendo que transceptor opto-electrónico uses, la adaptación de los niveles de tensión, por lo demás, para una señal de on-off no necesitas preocuparte de codificaciones ni nada que te complique la existencia.
No se si esto te responde a algo, si necesitas algo más concreto especifícalo un poco más.
Suerte y un saludo.