hola Silth,
he leido muy poco los link que pusiste, porque solamente me queda decirte que te haga un programador sencillo, claro que para hacerte un programador debe tener otro programador, pero pero todos los programadores sencillos por el puerto Serial o paralelo no funcionan 100% con una pentium IV, al menos que tenga una targeta con Puerto Serial/Paralelo y la puede configurar con algunos programa, ojo yo tengo la suerte que tengo una PC vieja pentium III y WinXP instalado y uso un STK300 muy sencillo de hacer pero uso el Software BascomAVR, se que funciona con el programa Ponny y creo con el WinAVR, siendo asi si usa el WinAVR y una pentium III con conector Paralelo te seria mas facil, hay muchas explicacion en internet y en la pagina donde lo baja, basta que tenga un conector Sub25 y poco componente,resistencia y condensadores.
leete
aqui o
aquiojos nunca lo he usado, tambien debo decirte que para aprender hay que leer, si te lee aqui en nuestros foro se hablo muchos de todos estos, es cuestion de leer el indice de nuestro foro de Atmel, tutorial para quemar el micro tambien lo encuentra.
Saludos y suerte