En esta figura se puede observar que se utiliza el mismo pin de referencia para medir los voltajes de las líneas, y tengo entnedido que en la mayoría de sistemas trifásicos existe una línea a la que llamamos griega, en la cual el voltaje entre línea y neutro es aproximadamente 207V y en las otras dos es 120V.
Creo que pusiste los valores al revés.
Excepto que en Nicaragua el sistema trifásico sea desvalanceado en voltaje? (que puede ser, pues no conozco de estos temas)
Las fases deberían tener todas la misma tensión respecto del neutro (120 en este caso) y entre fase y fase tendrían 3
1/2 * 120 = 207.84
Creo que a eso te refieres o si no entendí todo mal.
Respecto a la medición de potencia o energía, creo que no importa como se conecte una carga (sea estrella o triangulo) o si está balanceada o no, lo que se mide es la tensión y Corriente de cada fase por separado respecto del neutro y se suman algebraicamente. La corriente nunca se mide sobre el neutro, ya que esta puede incluso ser cero si el sistema esta perfectamente balanceado y no hay pérdidas a tierra.
Si tienes un sistema sin neutro (o neutro flotante), entonces sí mides entre fase y fase, pues no queda otra, la corriente sigue siendo por fase.
Para medir tensión de fase a fase el chip según veo tiene entradas diferenciales, el problema es la AGND que es común a todos los conversores.
Si usaras 3 MCP3909 ponés la AGND a una fase adyacente a la que deseas medir
pero en este caso no sé, me parece que deberías de alguna manera generarte un neutro, con un trafo estrella quizas
o tal vez simplemente con 3 resistencias de alta impedancia se pueda no estoy seguro.