Sí, bueno, si la cuestión es que no sé de qué manera "invocas" el compilador del CCS desde MPLAB, porque no veo ninguna opción, aunque tenga el CCS integrado con MPLAB. He probado a ponerlo como editor externo pero me da error.
En un proyecto que haya creado usando como compilador el CCS puedo acceder a las propiedades del compilador para ese proyecto (en Build Options...), y si añado las rutas que dijiste (en "Include Search Path") efectivamente funciona, pero únicamente para ese proyecto. Si creo otro nuevo tengo que volver a hacerlo. A mí el IDE del CCS me da igual, yo sólo quiero que guarde las rutas de las librerías. He probado incluso a buscar el archivo de opciones en la carpeta de PICC, pero nada.
En fín, ya me da casi vergüenza ser tan negado, pero... bueno, seguiré investigando.
Saludos!