Como lo probaste, en proteus o fisicamente con el pic? ahorita ya puedo leer los pulsos en el timer 1, esta bien raro de hecho debo tener las dos terminales del encoder conectadas a la tablilla, para poder leer los pulsos, esto solo lo hace con el timer 1 sigo sin leer los pulsos en el timer 0 y eso que si le llega el tren de pulsos.
Saludos y gracias por su atencion.