depende del tipo de variable q estes usando. En el caso de q sea flotante, usas fabs como bien dijo sycho. En caso contrario tendras q castear la variable o usar directamente la funcion abs(). Y si no, vos mismo podes programar una pequeña funcion q haga lo q decis... si es positivo q quede como esta, y si es negativo q lo multiplique por -1 y listo.
saludos!