Vamos por pasos
1) Menú Debugger , Select Tool, Habilitar MPLAB Sim . Con esto habilitas el simulador.
2) Configure, Select Device (eliges el pic que quieres simular)
3) File, Import. Incorporas el archivo .HEX
Con estos pasos, habilitaste el simulador, seleccionaste el pic a simular y le 'has cargado' el .HEX que tu deseas.
No hace falta compilar nada.
Si haces VIEW, PROGRAM MEMORY, tendrás un listado desensamblado de tu código, el cual podras guardar a un archivo. Para ello, clickea con el boton derecho del mouse y elige. OutPut To File
Por supuesto deberás acomodar varias cosas pero eso es lo más simple usando el MPLAB.
Si quieres solo simular, puedes hacerlo con F7 (instrucción x instrucción), F8 (ejecuta subrutinas completas), F9 (corre hasta encontrar un 'breakpoint), F6 (reset del pic).
Luego haces VIEW , WATCH y ahi agregas las posiciones de memoria que quieras ver o bien VIEW SFR para ver los registros de los módulos del PIC.
Para más información, te sugiero que leas la MPLAB IDE USER'S GUIDE que está en la página de Microchip en el mismo lugar donde bajas el IDE.
Saludos