Yo no he catado nunca el tutorial que reclamas, vamos, no sé si existe, pero te aseguro que si te das cabezazos contra Eagle conseguirás exprimirlo sin problemas.
Si quieres, ve preguntando por aquí todas tus dudas y verás como poco a poco lo consigues. Te aseguro que merece la pena.
Con respecto a tus primeras dudas:
1) Con respecto a las librerías, yo las tengo todas marcadas con "Use". De esta forma, aunque tarde un poco más en cargar, tengo la garantía de que encontraré el componente si existe. Para ello, puede hacerlo desde el "Control panel", marcando con el botón derecho del ratón sobre "Libraries" y activando la opción "Use all". Concretamente, los componentes que tú buscas están en:
- LM741: en librería Linear, dentro de la opción *741, tienes 4 modelos
- LM555: en la misma librería, opción *555, hay 8 modelos
- resistencias estándar: mira la librería RCL. Tiene lo más habitual en formatos de resistencias y condensadores.
2) ¿Qué significa que al exportar las pistas no sale del todo bien?, ten en cuenta que en Eagle se imprime lo que se ve en pantalla, por tanto, antes de hacerlo, tienes que mostrar/ocultar las capas que te interesen.