Se me ocurren 2 cosas, o usas los saltos de lineas (\r y/o \n ) como decis, pero sin el Enter ( 0x13 ), ya que no tendria sentido, y asi podes usarlo al enter libremente.
O la otra es tener un valor de inicio ejemplo 0xFF, seguido de la cantidad de bytes, y luego el dato, CRC si queres. De esa forma podes enviar cualquier cosa.