Aunque no entiendo a que te refieres con: "aunque no tengan una estructura básica como digamos un transistor o un diodo", la respuesta a tu pregunta es: SI se puede. Hay dos formas de hacerlo, crear tu propio modelo de simulacion, (imposible si no dominas muy bien Proteus, las matematicas, la logica y la electronica) y la segunda forma seria tomar el modelo de simulacion de otro componente que tenga la misma o mismas funciones que el tuyo y asignarsela a este.
El segundo caso yo lo utilice con el componente TPIC6C596,
http://www.todopic.com.ar/foros/index.php?topic=41684.0. Leelo, igual te sirve de guia.
Saludos.
