Buenas. Al final lo he podido resolver. Mi intención era hacer las configuraciones directamente en los registros sin tocar las librerias pero al final he tenido que usarlas con la ayuda del STcube mx. Dejo el código por si puede ayudar a alguien algún día. Un saludo.
#include "stm32f3xx_hal.h"
TIM_HandleTypeDef htim3;
void SystemClock_Config(void);
static void MX_GPIO_Init(void);
static void MX_TIM3_Init(void);
int main(void)
{
HAL_Init();
SystemClock_Config();
HAL_NVIC_SetPriorityGrouping(NVIC_PRIORITYGROUP_0);
HAL_NVIC_SetPriority(SysTick_IRQn, 0, 0);
HAL_NVIC_SetPriorityGrouping(NVIC_PRIORITYGROUP_0);
HAL_NVIC_SetPriority(RCC_IRQn, 0, 0);
HAL_NVIC_EnableIRQ(RCC_IRQn);
MX_GPIO_Init();
MX_TIM3_Init();
while (1)
{
GPIOA->ODR=TIM3->CNT;
}
}
void SystemClock_Config(void)
{
RCC_ClkInitTypeDef RCC_ClkInitStruct;
RCC_ClkInitStruct.ClockType = RCC_CLOCKTYPE_HCLK|RCC_CLOCKTYPE_SYSCLK
|RCC_CLOCKTYPE_PCLK1;
RCC_ClkInitStruct.SYSCLKSource = RCC_SYSCLKSOURCE_PLLCLK;
RCC_ClkInitStruct.AHBCLKDivider = RCC_SYSCLK_DIV8;
RCC_ClkInitStruct.APB1CLKDivider = RCC_HCLK_DIV2;
RCC_ClkInitStruct.APB2CLKDivider = RCC_HCLK_DIV1;
HAL_RCC_ClockConfig(&RCC_ClkInitStruct, FLASH_LATENCY_0);
__SYSCFG_CLK_ENABLE();
}
void MX_TIM3_Init(void)
{
TIM_ClockConfigTypeDef sClockSourceConfig;
TIM_MasterConfigTypeDef sMasterConfig;
htim3.Instance = TIM3;
htim3.Init.Prescaler = 0;
htim3.Init.CounterMode = TIM_COUNTERMODE_UP;
htim3.Init.Period = 32; //umbral máximo
htim3.Init.ClockDivision = TIM_CLOCKDIVISION_DIV1;
HAL_TIM_Base_Init(&htim3);
sClockSourceConfig.ClockSource = TIM_CLOCKSOURCE_ETRMODE2;
sClockSourceConfig.ClockPolarity = TIM_CLOCKPOLARITY_NONINVERTED;
sClockSourceConfig.ClockPrescaler = TIM_CLOCKPRESCALER_DIV1;
sClockSourceConfig.ClockFilter = 0;
HAL_TIM_ConfigClockSource(&htim3, &sClockSourceConfig);
sMasterConfig.MasterOutputTrigger = TIM_TRGO_UPDATE;
sMasterConfig.MasterSlaveMode = TIM_MASTERSLAVEMODE_DISABLE;
HAL_TIMEx_MasterConfigSynchronization(&htim3, &sMasterConfig);
__TIM3_CLK_ENABLE();
TIM3->CNT=0; //valor inicio
TIM3->CR1|=0x0001; //timer 3 en ON.
}
void MX_GPIO_Init(void)
{
GPIO_InitTypeDef GPIO_InitStruct;
__GPIOA_CLK_ENABLE();
__GPIOD_CLK_ENABLE();
GPIO_InitStruct.Pin = GPIO_PIN_0|GPIO_PIN_1|GPIO_PIN_2|GPIO_PIN_3
|GPIO_PIN_4|GPIO_PIN_5|GPIO_PIN_6|GPIO_PIN_7
|GPIO_PIN_8|GPIO_PIN_9|GPIO_PIN_10|GPIO_PIN_11
|GPIO_PIN_12|GPIO_PIN_13|GPIO_PIN_14|GPIO_PIN_15;
GPIO_InitStruct.Mode = GPIO_MODE_OUTPUT_PP;
GPIO_InitStruct.Pull = GPIO_NOPULL;
GPIO_InitStruct.Speed = GPIO_SPEED_MEDIUM;
HAL_GPIO_Init(GPIOA, &GPIO_InitStruct);
}