Hola:
El PIC convierte desde 0 (tension igual a v ref-) a 1023 (tensio igual a Vref+). Podes elegir las tensiones de referencia internas con el modulo de referencia o externas a traves de pines Vref+ y Vref- sacrificando dos pines del conversor para ello. Lo mejor es usar la referencia Vref- como masa o VSS y Vref+ como la alimentacion VDD.
ATENCION: si decidis utilizar otras referencias de tensión diferentes a VSS y VDD tene en cuenta que la diferencia de tensión VDD-VSS debe ser mayor a 2 volts y VDD debe ser mayor que 2,5 volts. Fijante en el maual del PIC y mira bien los datos, porque tuve problemas en el PIC16F877.
Con respecto al resultado, justificar a la izq o derecha se debe a una compatibilidad hacia atras con los modelos de 8 bits. La justificación izq deja los 8 bits más significativos en ADRESH, siendo compatible con los modelos de conversor de 8 bits si ignoras los dos de menor peso que quedan en ADRESL. Pero si usas justificacion derecha, entonces la idea es convertir en 10 bits utilizando ADRESH como el valor MSB y ADRESL como LSB.
Saludos