Hola skybotter!
Estas un poco equivocado con lo q decis. El puerto USB lleva 4 lineas, de las cuales 2 son para alimentacion, y otras 2 para datos. Para llevar a cabo la comunicacion se usa todo un protocolo, no es como prender y apagar lineas nada mas (como lo seria el puerto paralelo por ej). Por lo tanto, si queres prender y apagar leds, necesitas un controlador q interprete ese protocolo y haga lo q le pidas.
No es nada facil si no tenes conocimientos de electronica o programacion, te recomiendo q empieces por cosas mas simples.
Saludos!