Hola alex.
Basicamente lo q tenes q hacer es configurar el pin al cual el pulsador esta conectado como entrada. Luego, tenes q verificar si dicho pin esta en 1 periodicamente. Si esta en 1, vas a la rutina q hace parpadear el led.
Por favor, necesitamos mas informacion al respecto... podrias subir el codigo q tenes hasta ahora?