Yo siempre he utilizado un save que grabe hace tiempo cuando empecé a utilizarlo que no lo veo por hay si lo encuentro lo posteo, pero si quieres usarlo ya y te solucione lo de los puentes realiza lo siguiente:
Cuando tengas el esquema pasas a board y después de situar los componentes grabas por si no te gusta lo que realiza el autoroute, le das a auto luego a load te vas a ejemplos buscas la carpeta de singleside y cargas el fichero singleside v ó h, según te corresponda le das a ok y te hace los puentes,
cambiando el sentido de pistas en el menú de auto puedes hacer que salgan mas o menos puentes en el diseño(eso fue lo que ice y después de muchas pruebas me grabe una configuración buena para lo que realizo normalmente).
Saludos.