Definitivamente es posible. Yo no lo he intentado de esa manera, pero he encontrado algunas instrucciones para usar SDCC (Compilador C para PIC y otros microcontroladores) en conjunto con eclipse.
Busca en google: eclipse sdcc toolchain y encontrarás bastante información al respecto.
Yo lo que he hecho es usar el SDCC con Codeblocks (que es el IDE) que cumple la función de Eclipse.
Saludos,
elreypic.
