Que PIC estas usando ? Para aunque sea buscar el datasheet y ayudarte para ver si se encuentra alguna solucion. Parece ser uno de la familia PIC18 por el set de instrucciones y 2 prioridades de interrupcion.
EDIT:
Con el codigo que pasaste:
Algunas cosas, estas configurando el timer 1 con alta prioridad cuando veo que creo estas haciendo una de "baja prioridad",
Tenes activado ambas prioridades, imagino que tenes otra interrupcion. Y que baja prioridad lo tenes en un ORG 0x18
Adema de eso no veo nada fuera de lo comun, podrias poner que se ponga a 1 una salida cuando entre a una interrupcion y a 0 cuando salga, para saber si realmente se te esta trabando en la interrupcion