Por lo que te alcanzo a entender probastes el drive y giraba el motor mandando pulsaciones, si es asi vuelve a probar para ver si realmente sigue trabajando, caso contrario el problema lo tienes en la interface, PC, o mal seteado el mach3, pero para poder ayudarte como corresponde tienes que poner mas datos, como esta seteado el Mach3 las conexciones , etc. todo lo que puedas sino es adivinar.
Saludos.