Hola Cerebro.
Por lo que veo, el diodo esta colocado para evitar alguna inversion accidental de la tension de entrada, pero a su vez esta provocando que la tension del circuito sea menor a los 5V de entrada debido a la caida de tension sobre el diodo, sobre todo con alguno o todos los reles activados debido a que esta tension crece con la corriente que circula a travez del mismo (hasta 1,1v).
Te sugiero que hagas un puente sobre este diodo de proteccion y tengas mucho cuidado con la polaridad de la tension de entrada. Aunque lo mejor seria rediseñar la placa y cambiar esta proteccion por otra que no modifique la tension de entrada.
Saludos