Hola, en el protocolo USB solo existe comunicación de maestro a esclavo: Host to Device. Las computadoras son siempre Hosts y conectar una computadora con otra mediante USB es imposible hasta la versión 2.0 (Host to Host).
Pero en la versión 3.0 ya hay forma de entablar comunicación Host to Host, pero es tecnología muy reciente y difícil de adquirir.
La forma fácil que se me ocurre es que compres dos convertidores USB a RS232 y se los pongas a tus equipos. RS232 es controlable por Labview.
Pero si lo único que quieres es comunicar tus dos equipos siempre puedes usar el tradicional RS232, ethernet, puerto paralelo, etc.