Hola, primero te recomiendo que armes una tabla para la lectura de la termocupla, esta tabla debe corresponder al tipo de termocupla que uses, si ya tenes la interface analogica podrás saber que valor te dara el adc por ejemplo para 5,10,15,20,25 grados (o menor separación para más resolución) esto es para linealizar el resultado, ya que la termocupla "en toda su escala" no es lineal (si solo vas a medir temperatura ambiente no hace falta).
Por otro lado, elgo economico es armarte un programador tipo JDM y usar el ic-prog o pic800 (usa un buscador y los encontras rapidamente).