Normalmente en la primera página del datasheet también te dicen cuantas veces puedes reprogramarlo o escribir en la flash. Yo te sugiero que escribas en la EEPROM únicamente cuando te haga falta.
A pesar del datasheet, lo típico es que se pueda escribir le EEPROM unas 100 000 veces y leerla, todas las que necesites, por eso hay que tener muy claro cuando escribirla, yo tuve un amigo que de loco guardaba en la EEPROM un dato cada un segundo y a los pocos días ya no tenía EEPROM, así que es algo que hay que hacer con cautela, lápiz y calculadora en mano.
Saludos
Reinier