Hola guancho2002, tienes el mismo problema que yo tenia al principio.
Te explico un poco el sistema y la forma como yo lo hago...
Lo primero que debes hacer es definir con la herramienta "2D Graphics Box" un rectangulo o la forma que posea tu placa, y como consecuencia el tamaño de la misma, aunque despues la puedes modificar.
Esto se hace con la herramienta que posee un icono de un cuadrado verde, en mi caso esta a la izquierda, sobre la parte inferior, lo digo por si no sabes cual es.
Dicho rectangulo o forma debes hubicarlo en la capa "Board Edge", que la encontrarás en la parte inferior y es de color amarillo.
Una vez hecho esto, el programa ya sabe cual es la placa y podrá colocarte los componentes, pero lo hace muy mal.
Yo lo que hago es colocar lo primero los conectores o componentes similares que deben llevar una hubicación especifica, por ejemplo el borde de la placa.
Una vez hecho esto, si que dejo que el programa coloque los componentes, y despues le doy al "Auto Router", y podrás comprovar que saldrán trazos que no los puede realizar.
Aqui es donde ya debes ir modificando un poco la hubicacion de los componentes con tal de que pueda realizar todos los trazos.
Este es el sistema que hago yo, hay personas que prefieren hubicarlos todos manualmente, eso ya verás tu como lo quieres hacer cuando veas los resultados y demas.
Un saludo.