Hasta donde yo entiendo,matlab no tiene la posibilidad de generar ejecutables,al menos con la idea de resolver problemas numéricos,plotear gráficas ó calcular espectros haciendo uso de scripts.Si bien,matlab es inmenso y tiene infinidad de recursos y subaplicaciones,puede que haya por ahí algún tipo de plugin que te permita construir un .exe para implementar funciones muy muy concretas,quizá compilando código y construyendo algún tipo de dll,control ocx,etc...
De no ser así,dudo que consigas hacer correr tu script fuera del entorno de matlab